Objevuj zákonitosti molekulárního světa, navrhuj nová léčiva a moderní materiály pomocí superpočítačů a umělé inteligence na Přírodovědecké fakultě UP v Olomouci.
Uplatnění absolventů ve výzkumu i praxi
Člen evropské výzkumné infrastruktury
Individuální přístup a práce v týmech
Grotthussův mechanismus & přenos protonů
Voda podléhá neustálé autoprotolýze. Místo toho, aby se ion H3O+ pohyboval kapalinou pomalou difúzí, dochází k bleskovému přeskakování protonu (H+) po síti vodíkových můstků mezi sousedními molekulami.
⚡ Díky tomu mají protony ve vodě mimořádnou mobilitu – klíč k acidobazickým reakcím, buněčnému dýchání i enzymatické katalýze!
Fascinující spojení přírodních věd a moderních technologií. Nemusíš trávit hodiny v laboratoři s pipetou – tvou laboratoří je špičkový počítač a výkonné klastry.
Pochopení chemické vazby, reaktivity, struktury DNA, bílkovin i nanomateriálů. Zkoumáme, jak atomy tvoří svět kolem nás.
Programování v Pythonu, práce na Linuxu, analýza velkých dat, skládání proteinů pomocí AI (AlphaFold) a návrh algoritmů pro chemii.
Využití Newtonových zákonů a kvantové mechaniky k přesnému popisu pohybu elektronů a atomů v čase a prostoru.
Jsme součástí národního uzlu evropské výzkumné infrastruktury ELIXIR CZ pro bioinformatiku, datové zdroje a výpočetní biologii.
Budeš počítat na dedikovaných fakultních GPU klastrech a serverech optimalizovaných pro molekulovou dynamiku, kvantovou chemii a AI.
Nejsme anonymní velkovýrobna studentů. Už od prvního ročníku se můžeš zapojit do reálných vědeckých projektů s osobním mentorem.
Špičkově vybavená moderní budova Přírodovědecké fakulty s výhledem na historické centrum nejkrásnějšího studentského města v ČR.
Jasná a logická struktura od základů přírodních věd a programování až po pokročilé simulace na klastrech.
Přímo navazující dvouleté magisterské studium programu Fyzikální chemie nabízí specializovaný směr zaměřený na pokročilé metody počítačové chemie, molekulového modelování a výpočetního materiálového výzkumu.
Simulace DNA, RNA, transportních kanálů v membránách a hybridní metody QM/MM.
Kvantové výpočty 2D materiálů (grafen, MOFy), fotovoltaika a katalyzátory pro zelenou energii.
Virtuální screening milionů sloučenin, molekulární dokování a predikce ADMET vlastností.
Absolventi počítačové chemie jsou mimořádně žádaní díky unikátní kombinaci přírodovědného myšlení a špičkových IT/programátorských dovedností.
Vývoj a optimalizace nových léčiv, virtuální screening a modelování interakcí s receptory ve farmaceutických firmách (Zentiva, Roche, Oncodata).
Algoritmizace, analýza velkých dat, strojové učení a vývoj vědeckého softwaru pro technologické a analytické firmy.
Návrh materiálů pro baterie nové generace, solární články, senzory a nanotechnologie v průmyslovém i aplikovaném výzkumu.
Pokračování v doktorském studiu na PřF UP, ÚOCHB AV ČR nebo na předních světových univerzitách v Evropě a USA.
Učit tě budou špičkoví vědci s bohatými mezinárodními zkušenostmi a granty.
Garantka studijního programu Počítačová chemie. Mezinárodně uznávaná specialistka na vývoj a zpřesnění silových polí pro nukleové kyseliny (světoznámá OL parametrizace pro RNA a DNA – např. OL3, OL15, epsilon/zeta torze), která je dnes celosvětovým standardem v balíku AMBER. Vyučuje Molekulové modelování 2 (MOM2), Chemický software, Jadernou chemii a vede bakalářské práce.
Garantka programu Silová pole (OL parametrizace) DNA & RNA dynamika AMBERSpecialista na výpočetní bioinformatiku, membránové transporty, drug design, spoluautor celosvětového vizualizačního standardu Mol* (Molstar.org, Nucleic Acids Research 2021) a webových nástrojů infrastruktury ELIXIR CZ (MOLE, ChannelsDB, 3D Orbital Simulator). Vyučuje Fyzikální chemii 1, Strukturu atomů a molekul a Racionální návrh léčiv.
Mol* Co-author ELIXIR CZ Drug Design BioinformatikaMezinárodně uznávaný odborník na kvantovou chemii, nekovalentní interakce biomolekul a parametrizaci silových polí. Je spoluautorem celosvětově referenčního benchmarkového datasetu S66 (a S22) pro nekovalentní interakce v biomolekulách. Vyučuje předměty Chemická struktura, Molekulové modelování 1 (MOM1) a Modelování materiálů a nanomateriálů.
S66 Benchmark Kvantová chemie Nekovalentní interakce Materiálové simulaceMezinárodně uznávaný odborník na molekulární dynamiku nukleových kyselin, nekanonické struktury DNA a RNA (zejména G-kvadruplexy), koordinaci iontů a zpřesňování silových polí. Zabývá se pokročilými simulačními a vzorkovacími metodami a strukturální biologií. Vyučuje Molekulové modelování a podílí se na vedení studentských prací.
G-kvadruplexy Molekulární dynamika DNA & RNA struktura Pokročilé vzorkováníZabývá se teoretickým studiem reakčních mechanismů, povrchovou chemií, katalýzou a kvantově-chemickými simulacemi materiálů. Vyučuje Modelování chemických reakcí (MCHR), Modelování materiálů a nanomateriálů a oborové semináře.
Reakční mechanismy DFT Výpočty KatalýzaOdborník na chemickou informatiku, chemoinformatické algoritmy, reprezentaci molekul a správu vědeckých databází (např. v rámci ELIXIR CZ). Vyučuje předměty Chemická informatika (CHIN), Chemické databáze (CHD), Programování pro chemiky a Strukturu atomů a molekul.
Chemoinformatika Chemické databáze ELIXIR CZ